Aegean Airlines heeft een viertal nieuwe vliegroutes opgenomen. Vanaf Corfu is er een verbinding met Thessaloniki, vanuit Athene naar Sitia (Kreta) en tussen Thessaloniki en Kalamata en Thessaloniki en Samos. Aegean Airlines won in 2008-2009 de gerenommeerde award voor beste regionale luchtvaartmaatschappij van Europa.